تجمع ضایعات خوراک در استخر میگو می‌تواند منجر به کاهش کیفیت آب، افزایش بیماری‌ها و هدر رفت منابع شود. برای جلوگیری از این امر، چندین راهکار کلیدی وجود دارد:

1.  مدیریت دقیق غذادهی: مهم‌ترین راهکار، کنترل دقیق میزان و زمان غذادهی است. باید میزان غذای داده شده را بر اساس وزن، تعداد و مرحله رشد میگوها محاسبه کرد و از بیش‌خوری جلوگیری نمود . مشاهده رفتار غذادهی میگوها و تنظیم میزان غذا بر اساس آن بسیار حیاتی است.
2.  استفاده از فیدرهای اتوماتیک: فیدرهای اتوماتیک می‌توانند با توزیع یکنواخت و کنترل‌شده غذا، از هدر رفت و تجمع ضایعات جلوگیری کنند .
3.  انتخاب خوراک باکیفیت و پایدار: استفاده از خوراک‌هایی که پایداری مناسبی در آب دارند (مثلاً به اندازه کافی سریع متلاشی نمی‌شوند) و توسط میگوها به راحتی جذب می‌شوند، میزان ضایعات را کاهش می‌دهد .
4.  بهبود ضریب تبدیل غذایی (FCR): با بهبود FCR، میزان غذای مصرفی برای هر واحد افزایش وزن کاهش می‌یابد و در نتیجه ضایعات نیز کمتر می‌شود .
5.  نظارت و نگهداری استخر: پاک‌سازی منظم استخر و استفاده از سیستم‌های تصفیه مناسب می‌تواند به کنترل ضایعات کمک کند.

به طور خلاصه، ترکیب مدیریت علمی غذادهی، استفاده از تجهیزات مناسب و انتخاب خوراک باکیفیت، بهترین راه برای جلوگیری از تجمع ضایعات خوراک در استخر میگو است.